Sinüzit ameliyatlarında endoskop veya teleskop denilen ışıklı ince boru şeklinde cihazların kullanılması burun içlerinin hatta açılı olanlar kullanıldığında sinüs içlerinin de görülmesine olanak sağladığı için elzemdir. Böylelikle sinüs içleri ve çıkışlarındaki hastalıklar temizlenir. Genel anestezi altında yapılan bir ameliyattır. Hangi sinüs veya sinüsler etkilendiyse o bölgeye yönelik cerrahi uygulanır. Amaç dokulara en az zararı vererek mümkün olduğunca konservatif ama etkili cerrahiyi uygulamaktır. Endoskopik sinüs cerrahisi denilen bu yöntem ile burun ve sinüs içindeki iltihaplı dokular alınır ve sinüs çıkışları açılır. Drenaj yolları genişletilmiş olur. Böylece hem hastadaki enfeksiyon yükü azaltılmış olur, hem de olabilecek sinüzit ataklarını daha kolay geçirmesi sağlanır.

Ameliyat sonrasında eğer septum deviasyonu denilen burun eğriliğine yönelik bir müdahalede de bulunulmadıysa sıklıkla birkaç gün içinde kendinden eriyen tamponlar kullanılır. Hasta aynı gün veya ertesi gün taburcu edilir. Genellikle ağrı olmaz. Burun yıkaması ile burun içinin temizlenmesine birkaç hafta devam edilir. 7-10 gün sonra işine başlayabilir. Ancak yeni enfeksiyon ile karşılaşmaması bakımından 15 günlük istirahat önerilir. Tam iyileşme 4-6 hafta civarında bir süreçtir.